BigWig je formát souboru pro zobrazení hustých, souvislých dat ve stopě prohlížeče genomu, vytvořený převodem z formátu Wiggle (WIG). Formát BigWig je popsán na webových stránkách UCSC Genome Bioinformatics a průvodce formátem souborů Broad Institute poskytuje další informace.
Co je formát bigWig?
Formát bigWig je pro zobrazení hustých, souvislých dat, která budou zobrazena jako graf Soubory BigWig jsou původně vytvořeny ze souborů typu WIG pomocí programu UCSC wigToBigWig. Alternativně lze soubory bigWig vytvořit ze souborů bedGraph pomocí programu UCSC bedGraphToBigWig.
Jak mohu použít soubor bigWig?
Přesuňte nově vytvořený soubor bigWig (myBigWig.bw) do webového umístění http, https nebo ftp. Vložte adresu URL do formuláře pro zadání vlastní stopy nebo vytvořte vlastní stopu pomocí jednoho řádku stopy. Vložte řádek vlastní stopy do textového pole na stránce správy vlastní stopy.
Co je to bigWig track?
stopy bigWig jsou stopy pro spojité signály napříč celým genomem. Jsou vhodné pro zobrazení různých „surových“výsledků experimentů, jako jsou signály ChIP-Seq, signály RNA-Seq atd.
Jak vytvořím soubor bigWig?
Existuje několik způsobů, jak generovat velké soubory. To obvykle zahrnuje konverzi souboru. bam soubor na viklavou stopu (. wig) a poté převedení chvějící se stopy na binární bigwig (.
