Trypsin štěpí peptidovou vazbu mezi karboxylovou skupinou argininu nebo karboxylovou skupinou lysinu a aminoskupinou sousední aminokyseliny. Rychlost štěpení probíhá pomaleji, když lysinové a argininové zbytky sousedí s kyselými aminokyselinami v sekvenci nebo cystinem.
Kde trypsin štěpí aminokyseliny?
Trypsin štěpí peptidy na C-terminální straně aminokyselinových zbytků lysinu a argininu. Pokud je prolinový zbytek na karboxylové straně místa štěpení, ke štěpení nedojde.
Jakou sekvenci trypsin řeže?
Trypsin štěpí výhradně C-terminál na zbytky argininu a lysinu Téměř všechny velké projekty v proteomice založené na hmotnostní spektrometrii používají trypsin k přeměně proteinových směsí na snadněji analyzovatelné peptidy populace.
Jaké aminokyseliny štěpí trypsin a chymotrypsin?
Trypsin snižuje na lysin a arginin, zatímco chymotrypsin. řeže tyrosin, fenylalanin a tryptofan. Jak enzym ví, že tam má krájet? Navrhněte alternativu pro aspartát a histidin v katalytické triádě.
Jaké aminokyseliny štěpí pepsin?
Pepsin štěpí peptidové vazby na amino-koncové straně cyklických aminokyselinových zbytků ( tyrosin, fenylalanin a tryptofan), čímž štěpí polypeptidové řetězce na menší peptidy (Fange a Grove, 1979).
