Logo cs.boatexistence.com

Jak se provádí metagenomika?

Obsah:

Jak se provádí metagenomika?
Jak se provádí metagenomika?

Video: Jak se provádí metagenomika?

Video: Jak se provádí metagenomika?
Video: Metagenome | Metagenomics | Metagenomics Workflow | 2024, Smět
Anonim

Metagenomika je definována jako přímá genetická analýza genomů obsažených v environmentálním vzorku Tato oblast původně začala klonováním environmentální DNA, po které následoval funkční screening exprese [1], a byl pak rychle doplněn přímým náhodným sekvenováním environmentální DNA [2, 3].

Jaký je proces metagenomiky?

Metagenomika zahrnuje získávání DNA ze všech mikroorganismů v rámci komunity, aniž by bylo nutné nutně identifikovat všechny zúčastněné druhy. Poté, co jsou geny sekvenovány a porovnány s identifikovanými sekvencemi, lze určit funkce těchto genů.

Jaká technika se používá v metagenomice?

Vzorek mikrobiální komunity se odebírá z mořské vody, sedimentu, hostitelského zvířete nebo jiného mořského prostředí. Shromážděné buňky se poté lyžují a z jejich lyzátu se extrahuje DNA. Technika, která umožňuje metagenomiku, je shotgun sequencing, která sekvenuje náhodné oblasti DNA necíleným způsobem.

Jaké jsou 3 kroky ke studiu metagenomiky?

Kroky a proces metagenomiky:

  1. Sbírka vzorků:
  2. Extrakce DNA:
  3. Příprava vzorku:
  4. Vzorková analýza:

Jak se provádí funkční metagenomika?

Funkční metagenomika zahrnuje izolaci DNA z mikrobiálních komunit za účelem studia funkcí kódovaných proteinů. Zahrnuje klonování fragmentů DNA, expresi genů v náhradním hostiteli a screening na enzymatické aktivity.

Doporučuje: