Metagenomika je definována jako přímá genetická analýza genomů obsažených v environmentálním vzorku Tato oblast původně začala klonováním environmentální DNA, po které následoval funkční screening exprese [1], a byl pak rychle doplněn přímým náhodným sekvenováním environmentální DNA [2, 3].
Jaký je proces metagenomiky?
Metagenomika zahrnuje získávání DNA ze všech mikroorganismů v rámci komunity, aniž by bylo nutné nutně identifikovat všechny zúčastněné druhy. Poté, co jsou geny sekvenovány a porovnány s identifikovanými sekvencemi, lze určit funkce těchto genů.
Jaká technika se používá v metagenomice?
Vzorek mikrobiální komunity se odebírá z mořské vody, sedimentu, hostitelského zvířete nebo jiného mořského prostředí. Shromážděné buňky se poté lyžují a z jejich lyzátu se extrahuje DNA. Technika, která umožňuje metagenomiku, je shotgun sequencing, která sekvenuje náhodné oblasti DNA necíleným způsobem.
Jaké jsou 3 kroky ke studiu metagenomiky?
Kroky a proces metagenomiky:
- Sbírka vzorků:
- Extrakce DNA:
- Příprava vzorku:
- Vzorková analýza:
Jak se provádí funkční metagenomika?
Funkční metagenomika zahrnuje izolaci DNA z mikrobiálních komunit za účelem studia funkcí kódovaných proteinů. Zahrnuje klonování fragmentů DNA, expresi genů v náhradním hostiteli a screening na enzymatické aktivity.
