3.2. Svinuté cívky se vytvoří když se dva nebo více α-helixů samovolně sestaví navinutím kolem sebe a vytvoří levotočivou supercoil (obr. 3.1C). Ačkoli dimery, trimery a tetramery jsou nejběžnějšími strukturami, lze nyní normativně navrhnout větší stočené spirály až o sedmi helixech [8].
Kde se nalézají stočené cívky?
Coiled‐coils se nacházejí v proteinech ve všech třech královstvích života. Coiled‐coil domény některých proteinů jsou téměř neměnné v sekvenci a délce, čímž prozrazují strukturální a funkční roli aminokyselin po celé délce coiled‐coil.
Jak se stočené cívky drží pohromadě?
Svinutá spirála neboli superhelix je tvořena svinutím dvou, tří nebo čtyř α-helixů. Šroubovicová vlákna jsou držena pohromadě hydrofobní silou vytvořenou mezi nepolárními postranními řetězci z různých peptidových vláken.
Co je to spirálová struktura?
Svinuté závity jsou α-helikální struktury, ve kterých jsou spirály navinuty kolem sebe a vytvářejí superhelikální svazky. Obvykle se skládají ze dvou nebo tří šroubovic v paralelní nebo antiparalelní orientaci, ale byly určeny struktury se sedmi a více šroubovicemi.
Je mezi Helixem a cívkou rozdíl?
Helix je sekundární struktura a stočená spirála je supersekundární struktura, ale obě jsou výsledkem interaktivních sil mezi sousedními aminokyselinovými zbytky kolem peptidové vazby.
