Většina STR se nachází v nekódujících oblastech, zatímco pouze asi 8 % se nachází v kódujících oblastech (3). Navíc se jejich hustoty mezi chromozomy mírně liší. U lidí má chromozom 19 nejvyšší hustotu STR (4). V průměru se jeden STR vyskytuje na 2 000 bp v lidském genomu (5).
Kde najdu krátké tandemové opakování?
Separace DNAPo amplifikaci PCR se změří celková délka amplikonu STR, aby se určil počet repetic přítomných v každé alele nalezené v profilu DNA. Toto měření délky se provádí separací na základě velikosti zahrnující gelovou nebo kapilární elektroforézu (CE).
Kde se tandemová opakování nacházejí?
Tandemové repetice se vyskytují v DNA, když se vzor jednoho nebo více nukleotidů opakuje a tato opakování spolu přímo sousedí. Několik proteinových domén také tvoří tandemové repetice ve své primární struktuře aminokyselin, jako jsou repetice pásovce.
Kolik krátkých tandemových opakování existuje?
V roce 1997 Federální úřad pro vyšetřování (FBI) nominoval 13 autozomální STR lokusy, aby vytvořily jádro kombinovaného systému DNA indexu (CODIS), databáze sestávající z profilů přispěly federální, státní a místní forenzní laboratoře.
Mají všichni stejné krátké tandemové opakování?
Zkoumání těchto nekódujících oblastí odhaluje opakované jednotky DNA, které se mezi jednotlivci liší v délce. Vědci zjistili, že jeden konkrétní typ opakování, známý jako krátké tandemové opakování (STR), lze relativně snadno měřit a porovnávat mezi různými jednotlivci