Logo cs.boatexistence.com

Proč se glycin nenachází v alfa helixech?

Obsah:

Proč se glycin nenachází v alfa helixech?
Proč se glycin nenachází v alfa helixech?

Video: Proč se glycin nenachází v alfa helixech?

Video: Proč se glycin nenachází v alfa helixech?
Video: Lecture 05, concept 14: Proline has a ring and breaks helices 2024, Smět
Anonim

Všechny aminokyseliny se nacházejí v α-helixech, ale glycin a prolin nejsou běžné, protože destabilizují α-helix. Glycin je osvobozen od mnoha sterických omezení protože postrádá β uhlík. … Proline je na druhou stranu příliš tuhý.

Která aminokyselina se nenachází v alfa helixech?

Prolin se nenachází v alfa helikální struktuře proteinů, protože má speciální cyklickou strukturu (jde o iminokyselinu, nikoli o aminokyselinu), tento typ sekundární struktury má specifická šířka a specifický počet aminokyselinových zbytků/otočka. Proto je prolin považován za alfa helikální přerušovač.

Proč je glycin narušovač alfa helixu?

Prolin a glycin jsou někdy známé jako "přerušovače šroubovice" protože narušují pravidelnost konformace α spirálové páteře; oba však mají neobvyklé konformační schopnosti a běžně se vyskytují v tazích.

Kde je glycin v alfa šroubovici?

V motivu helix–turn–helix jsou tři pozice, které jsou vysoce konzervované. Alanin se obvykle nachází v poloze 5 v první α šroubovici; glycin se nachází na pozici 9, první pozici tahu; a buď valin nebo isoleucin se obvykle nachází na pozici 15 v rámci druhé šroubovice α.

Nacházejí se zbytky glycinu převážně v alfa šroubovicích?

Glycin se svými mnoha možnými konformacemi hlavního řetězce se zřídka vyskytuje také v šroubovicích. Když víme, jak pravděpodobný je výskyt aminokyseliny v alfa šroubovici (takzvané sklony ke šroubovici), je možné předpovědět, kde se v proteinové sekvenci vyskytují šroubovice.

Doporučuje: